虐杀器官剧场版改编自伊藤计划所著小说《虐杀器官》，也是该作者的遗作，虐杀器官剧场版讲述的是在近未来的非洲某个正在上演种族仇杀的国家，主人公是其中一方的士兵，同时也是个年仅十余岁的少年。实际上部队中许多都是十几岁的少年。
　　由联合国斡旋、终于达成停战协议的同时，“我”的最要好的战友被上司枪毙了。原因是“我”所在的部队屠杀另一族村落的时候，发现了他被掳走的妹妹。依照一条被普遍承认的真理，被掳走的女人一定已经污染了另一族的邪恶精血，绝不可以留存在世上，因此这个女人也应该当场格杀，但他非但不忍下手，还带着妹妹试图逃走。
　　即使这时候从本部已经传来了停战的指令，但是“军法还在”，上司如是说。动画版虐杀器官在今年的富士台倒A档中宣布剧场版制作，同时动画化的还有原作者的另一部遗作《harmony》，两部作品将于2015年上映。